هدف ما ، پیش بینی مناطق کد کننده ی پروتئین در ژن با استفاده از ویولت های با پنجره رنج وسیع

ابتدا هدف یافتن اگزون ها (نواحی کد کننده ی اطلاعات مربوط به ساخت پروتئین) در یک قسمت خاص از توالی DNA موسوم به ژن می باشد.(که این ژن ها نیز هر کدام مسئول تولید نوع خاصی از پروتئین در بدن هستند و پروتئین ها مانند میکرو رباتهایی هستند که تمام اعمال موجود در بدن را به عهده دارند). یافتن محل دقیق این اگزونها می تواند درطراحی دارو های مختلف و یافتن در مان برای بیماری ها مفید باشد.

چندین روش طیف- محور برای پیش بینی مناطق کد کننده پروتئین در DNA تا کنون پیشنهاد شده اند که موضوع برجسته در همه این تکنیک های پیشنهادی این است که آنها عموما وابسته به مقدار از پیش تعیین شده برای طول پنجره هستند که این مقادیر معمولا بر اساس آزمون و خطا انتخاب می شوند.

در این جستار ما یک پیشنهاد جدید بر مبنای ویولت های با پنجره رنج وسیع ارائه خواهیم داد. تجزیه و تحلیل پنجره ویولت پیشنهاد شده نشان داد که پاسخ فرکانسی آن می تواند با توجه به عرض سکانس سازگاری یابد، و بخاطر همین ویژگی قادر است اجازه گذر یا حذف را برای فرکانسهایی بجز فرکانس پایه ی تحلیل های سکانس DNA را فراهم آورد. این ویژگی به ما این امکان را می دهد که طولهای متفاوت از پنجره ها را در رنج گسترده ای انتخاب کنیم بدون اینکه نگران افت بازدهی باشیم. برای Validation  این روش در مقاله از منحنی های زیادی استفاده شده است. منحنی ROC برحسب  sensitivity (حساسیت) و ۱-Spesifity (قدرت تشخیص) رسم میشود.

پیش بینی مناطق کد کننده ی پروتئین در ژن با استفاده از ویولت های با پنجره رنج وسیع

Prediction of Protein Coding Regions Using a Wide-Range

Wavelet Window Method

Published in:   IEEE/ACM TRANSACTIONS

Date of Publication: JULY/AUGUST 2016

                                برای مشاهده مقاله ؛ تصویر فوق را کلیک کنید تا دانلود شود

مشخصات شبیه ساز:

کارشناسی ارشد مهندسی پزشکی

دانشگاه امیرکبیر

محتویات:

• اصل مقاله
• پیاده سازی با Matlab
• ضمیمه کردن گزارش فارسی و نتایج
• ضمیمه کردن دیتابیس

دانلود فایل